已測序的生物
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已測序的生物指其基因組已經被完全測序的生物。其中部分生物的DNA序列已經被完全註釋，功能性的片段（如基因等）已作圖。
借助於基因組研究及高通量處理等技術，越來越多的生物的全部基因被人們獲得。自從1995年以來已經有150個基因組被解密，將近每個星期有新的物種添加進來。
已測序的生物列表编辑
下表是目前爲止已經被相當完全測序的生物。
古菌编辑
細菌编辑
- Agrobacterium tumefaciens - Pflanzenpathogenes Bakterium, tumorbildend
- Aquifex aeolicus - Hyperthermophiles Meeresbakterium
- Bacillus anthracis - Anthrax-Erreger
- Bacillus cereus - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Bacillus halodurans - Enzymproduzierendes Bakterium（Industriell genutzt）
- Bacillus subtilis - Enzymproduzierendes Bakterium（Industriell genutzt）
- Bacteroides thetaiotaomicron - Darmbakterium
- Bifidobacterium longum - Darmbakterium
- Blochmannia floridanus - Bakterium in Symbiose mit Ernteameisen
- Bordetella bronchiseptica - Erreger chronischer Infektionen der Atemwege
- Bordetella parapertussis - Erreger von mildem Keuchhusten
- Bordetella pertussis - Erreger von Keuchhusten
- Borrelia burgdorferi - Borreliose-Erreger
- Bradyrhizobium japonicum - Knöllchenbakterium der Sojabohne
- Brucella melitensis - Erreger des Maltafiebers
- Brucella suis - potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend
- Buchnera aphidicola - Bakterium in Symbiose mit Blattläusen
- Burkholderia mallei - Erreger des Rotzes bei Huftieren, auch humanpathogen（Einsatz als Biowaffe）
- Burkholderia pseudomallei - Erreger der Melioidose, vor allem in Südostasien
- Campylobacter jejuni - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Caulobacter crescentus - Süßwasserbakterium
- Chlamydia muridarum - Atemwegsinfektionen bei Maus und Meerschweinchen
- Chlamydophila caviae - Augenentzündungen bei Meerschweinchen
- Chlamydia trachomatis - Erreger der Harnröhrenentzündung
- Chlamydophila pneumoniae - Erreger einer Bronchitis
- Chlorobium tepidum - Grünes Schwefelbakterium
- Chromobacterium violaceum - humanpathogenes Bakterium（Diarrhoe und andere Erkrankungen）
- Clostridium acetobutylicum - Aceton- und Butanol-produzierendes Bakterium
- Clostridium perfringens - Erreger Diarrhoe etc.
- Clostridium tetani - Tetanus-Erreger
- Corynebacterium diphtheriae - Erreger der Diphtherie
- Corynebacterium jeikeium - nosokomial pathogener Hautbewohner
- Corynebacterium efficiens - Bakterium zur Produktion von Aminosäuren u. a.
- Coxiella burnetti - Erreger des Q-Fieber
- Deinococcus radiodurans - extrem strahlungstolerantes Bakterium
- Desulfotalea psychrophila - extrem kältetolerantes Bakterium des arktischen Eismeeres
- Desulfovibrio vulgaris - Bakterium aus Ölfeldern, wirtschaftlicher Schädling
- Enterococcus faecalis - Darmbakterium, Modellorganismus
- Escherichia coli - Darmbakterium, Modellorganismus
- Fusobacterium nucleatum - Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag
- Haemophilus ducreyi - Erreger des Schanker
- Haemophilus influenzae - Erreger einer Erkältung
- Helicobacter hepaticus - Erreger chronischer Hepatis und von Lebergeschwüren bei Mäusen.
- Helicobacter pylori - Erreger von Magengeschwüren
- Lactobacillus plantarum - Milchsäurebakterium
- Lactococcus lactis - Käsebakterium
- Legionella pneumophila - Erreger der Legionärskrankheit
- Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium
- Leptospira interrogans - Erreger der Leptospirosis
- Listeria innocua - nicht pathogene Listeria-Art
- Listeria monocytogenes - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Mannheimia succiniciproducens - symbiotisches Bakterium im Magen von Kühen
- Mesoplasma florum - Bakterium mit extrem kleinen Genom
- Mesorhizobium loti - Knöllchenbakterium bei Lotus-Arten
- Mycobacterium leprae - Erreger der Lepra
- Mycobacterium bovis - Erreger der Rindertuberkulose
- Mycobacterium paratuberculosis - Erreger der Rinderkrankheit Johne's Desease
- Mycobacterium tuberculosis - Erreger der Tuberkulose
- Mycoplasma gallisepticum - Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung bei Geflügel
- Mycoplasma genitalium - Erreger von Infektionen des Genitaltraktes
- Mycoplasma penetrans - Erreger von Entzündungen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus（AIDS）
- Mycoplasma pneumoniae - Erreger einer Bronchitis
- Mycoplasma pulmonis - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege bei Mäusen
- Neisseria meningitidis - Erreger der Meningitis（Hirnhautentzündung）
- Nitrisomonas europaea - Nitratbakterium
- Oceanobacillus iheyensis - Tiefseebakterium
- Pasteurella multocida - Erreger von Vogelcholera, Ansteckender Kaninchenschnupfen, Hämorrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei Schweinen und Menschen u.a.
- Photorabdus luminescens - Bakterium in Symbiose mit insektenpathogenen Fadenwürmern
- Porphyromonas gingivalis - Erreger von Parodontose
- Prochlorococcus marinus - Meeresbakterium
- Pseudomonas aeruginosa - als Opportunist bei geschwächtem Immunsystem pathogen
- Pseudomonas putida - Bodenbakterium zum Abbau von Verseuchungen
- Pseudomonas syringae - Pflanzenpathogenes Bakterium, u. a. Tomatenschädling
- Ralstonia solanacearum - Pflanzenpathogenes Bakterium, Welke bei Hunderten verschiedener Pflanzenarten
- Rhodopirellula baltica - Rotes Meeresbakterium
- Rhodopseudomonas palustris - Purpurbakterium
- Rickettsia conorii - Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber
- Rickettsia prowazekii - Erreger des Typhus
- Rickettsia sibirica - Erreger von Zeckenfieber in Nordasien
- Rickettsia typhi - Erreger des Mäusetyphus（auch humanpathogen）
- Salmonella typhi - Erreger des Typhusfieber
- Salmonella typhimurium - Erreger des Typhusfieber bei der Maus
- Shewanella oneidensis - Metallabbauendes Bodenbakterium
- Shigella flexneria - evtl. Ursache von Plötzlichem Kindstod
- Sinorhizobium meliloti - Knöllchenbakterium des Alfalfa
- Staphylococcus aureus - Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks
- Staphylococcus epidermidis - Hautbakterium, pathogen bei Wunden
- Streptococcus agalactiae - Erreger von schweren Neugeboreneninfektionen, Meningitis u. a.
- Streptococcus mutans - Erreger von Karies
- Streptococcus pneumoniae - Erreger von Lungenentzündungen, Menigitis und Blutvergiftungen
- Streptococcus pyogenes - Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks u. a.
- Streptomyces avermitilis - Antibiotikaproduzierendes Bakterium（industriell genutzt）
- Streptomyces coelicolor - Antibiotikaproduzierendes Bakterium（industriell genutzt）
- Thermoanaerobacter tengcongensis - Bakterium aus heißen Quellen in Volksrepublik China
- Thermotoga maritima - sehr säureliebendes Bakterium, reinigt Bergwerkshalden u. a.
- Thermus thermophilus - hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz in der PCR und anderswo.
- Treponema pallidum - Erreger der Syphilis
- Tropheryma whippley - Erreger der Whipple-Krankheit
- Ureaplasma urealyticum - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes
- Vibrio cholerae - Erreger der Cholera
- Vibrio fischeri - Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die Qualitätsbestimmung von Abwasser verwendet wird
- Vibrio parahaemolyticus - Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen
- Vibrio vulnificus - Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr von rohen Meeresorganismen führen.
- Wigglesworthia glossinidia - Erreger der Schlafkrankheit
- Wolinella succinogenes - Bakterium im Kuhmagen
- Xanthomonas axonopodis - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Zitronenkrebs bei Zitrusfrüchten
- Xanthomonas campestris - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Schwarzfäule bei Kreuzblütern
- Xylella fastidiosa - Pflanzenpathogenes Bakterium, schwerer Schädling in Obst-, Nuss- und Kaffee-Plantagen in Nord- und Südamerika
- Yersinia pestis - Erreger der Pest
藍藻编辑
- Anabaena spec. - Fadenblaualge
- Gloeobacter violaceus - primitive Blaualge
- Synechococcus spec. - Meeres-Blaualge
- Synechocystis spec. - Meeres-Blaualge
- Thermosynechococcus elongatus - Thermophile Blaualge
真核生物编辑
原生生物编辑
- Leishmania infantum - 一種利什曼原蟲
- Leishmania major - 一種利什曼原蟲
- Plasmodium falciparum - 惡性瘧原蟲
- Plasmodium yoelii yoelii - 約氏瘧原蟲，引起嚙齒動物瘧疾
- Thalassiosira pseudonana - 一種海洋硅藻
- Trypanosoma brucei - 一種錐體蟲
- Trypanosoma congolense - 一種錐體蟲
- Trypanosoma cruci - 一種錐體蟲
- Trypanosoma vivax - 一種錐體蟲
真菌编辑
- Ashbya gossypii - 感染柑橘類和棉花的真菌
- Aspergillus fumigatus - 煙麴黴，人類致病菌
- Aspergillus nidulans - 構巢麴黴
- Debaryomyces hansenii - 耐鹽的酵母
- Encephalitozoon cuniculi - 一種單細胞微孢子蟲
- Kluyveromyces lactis - 具有潛在藥用生産價值的酵母
- Kluyveromyces waltii - 一種酵母
- Magnaporthe grisea - 稻熱病菌
- Neurospora crassa - 粗糙脈孢菌，橙色的麫包黴，模式生物
- Phanerochaete chrysosporium - 白腐病病菌
- Saccharomyces cerevisiae - 釀酒酵母，模式生物
- Schizosaccharomyces pombe - 粟酒裂殖酵母
- Trichoderma reesei = Hypocrea jecorina - 一種木黴
- Yarrowia lipolytica - 一種酵母
- Candida albicans - 白色唸珠菌，人類致病菌
植物编辑
- 物种基因组大小和开放阅读框文献
Sesamum indicum L. Sesame芝麻（2n = 26）293.7 Mb, 10,656 orfs1
Oryza brachyantha短药野生稻261 Mb, 32,038 orfs2
Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻105 Mb, 9,606 orfs3
Pyropia yezoensis susabi-nori海苔43 Mb, 10,327 orfs4
Prunus persica Peach桃226.6 of 265 Mb 27,852 orfs5
Aegilops tauschii山羊草（DD）4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs6
Triticum urartu乌拉尔图小麦（AA）4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs7
moso bamboo (Phyllostachys heterocycla)毛竹2.05 Gb (95%) 31,987 orfs8
Cicer arietinum Chickpea 鹰嘴豆~738-Mb，28,269 orfs 9520 Mb (70% of 740 Mb), 27,571 orfs10
Prunus mume梅280 Mb, 31,390 orfs11
Gossypium hirsutum L.陆地棉2.425 Gb12
Gossypium hirsutum L.雷蒙德氏棉761.8 Mb13
Citrus sinensis甜橙87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs14
甜橙367 Mb15
Citrullus lanatus watermelon西瓜353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs16
Betula nana dwarf birch，矮桦450 Mb17
Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻（产油藻类之一）28.7 Mb，11,973 orfs18
Triticum aestivum bread wheat普通小麦17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs19
Hordeum vulgare L. barley大麦1.13 Gb of 5.1 Gb，26,159 high confidence orfs，53,000 low confidence orfs20
Gossypium raimondii cotton雷蒙德氏棉D subgenome,88% of 880 Mb 40,976 orfs21
Linum usitatissimum flax亚麻302 mb (81%), 43,384 orfs22
Musa acuminata banana香蕉472.2 of 523 Mb, 36,542 orfs23
Cucumis melo L. melon甜瓜375 Mb（83.3%）27,427 orfs24
Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli梨（砀山酥梨）512.0 Mb (97.1%), 42,812 orfs25,26
Solanum lycopersicum番茄760/900 Mb，34727 orfs27
S. pimpinellifolium LA1589野生番茄739 Mb
Setaria狗尾草属（谷子、青狗尾草）400 Mb，25000-29000 orfs28,29
Cajanus cajan pigeonpea木豆833 Mb，48,680 orfs30
Nannochloropis gaditana一种海藻~29 Mb, 9,052 orfs31
Medicago truncatula蒺藜苜蓿350.2 Mb, 62,388 orfs32
Brassica rapa白菜485 Mb33
Solanum tuberosum马铃薯（DM）725 Mb,39031 orfs34
Thellungiella parvula条叶蓝芥13.08 Mb 29,338 orfs35
Arabidopsis lyrata lyrata玉山筷子芥?183.7 Mb, 32670 orfs36
Fragaria vesca野草莓240 Mb，34,809 orfs37
Theobroma cacao可可76% of 430 Mb, 28,798 orfs38
Aureococcus anophagefferens褐潮藻32 Mb, 11501 orfs39
Selaginella moellendorfii江南卷柏208.5 Mb, 34782 orfs40
Jatropha curcas Palawan麻疯树285.9 Mb, 40929 orfs41
Oryza glaberrima光稃稻（非洲栽培稻）206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs（>70% coverage）42
Phoenix dactylifera棕枣380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs43
Chlorella sp. NC64A小球藻属40000 Kb, 9791 orfs44
Ricinus communis蓖麻 325 Mb, 31,237 orfs45
Malus domestica (Malus x domestica) 苹果742.3 Mb46
Volvox carteri f. nagariensis 69-1b 一种团藻120 Mb, 14437 orfs47
Brachypodium distachyon 短柄草272 Mb，25,532 orfs48
Glycine max cultivar Williams 82栽培大豆1.1 Gb, 46430 orfs49
Zea mays ssp. MaysZea mays ssp. ParviglumisZea mays ssp. MexicanaTripsacum dactyloides var. meridionale无法下载附表50
Zea mays mays cv. B73玉米2.06 Gb, 106046 orfs51
Cucumis sativus 9930黄瓜243.5 Mb, 63312 orfs52
Micromonas pusilla金藻21.7 Mb, 10248 orfs53
Sorghum bicolor高粱697.6 Mb, 32886 orfs54
Phaeodactylum tricornutum三角褐指藻24.6 Mb, 9479 orfs55
Carica papaya L. papaya番木瓜271 Mb (75%), 28,629 orfs56
Physcomitrella patens patens小立碗藓454 Mb, 35805 orfs57
Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115 葡萄504.6 Mb, 29585 orfs58
Vitis vinifera PN40024 葡萄475 Mb59
Ostreococcus lucimarinus 绿色鞭毛藻13.2 Mb, 7640 orfs60
Chlamydomonas reinhardtii 莱茵衣藻100 Mb, 15256 orfs61
Populus trichocarpa 黑三角叶杨550 Mb, 45000 orfs62
Ostreococcus tauri 绿藻12.6 Mb, 7892 orfs63
Oryza sativa ssp. japonica 粳稻360.8 Mb, 37544 orfs64
Thalassiosira pseudonana硅藻25 Mb, 11242 orfs65
Cyanidioschyzon merolae 10D红藻16.5 Mb, 5331 orfs66
Oryza sativa ssp. japonica粳稻420 Mb, 50000 orfs67
Oryza sativa L. ssp. Indica籼稻 420 Mb, 59855 orfs68
Guillardia theta 蓝隐藻551 Kb, 553 orfs69
Arabidopsis thaliana Columbia 拟南芥119.7 Mb, 31392 orfs70
動物编辑
- Anopheles gambiae - 冈比亚按蚊
- Apis mellifera - 意蜂
- Bos taurus cattle - 牛
- Caenorhabditis briggsae - 一種線蟲
- Caenorhabditis elegans - 秀麗隱桿線蟲，模式生物
- Canis lupus familiaris dog- 狗
- Ciona intestinalis - 玻璃海鞘
- Ciona savignyi - 海鞘
- Drosophila melanogaster - 黑腹果蠅，模式生物
- Fugu rubripes - 河豚
- Gallus gallus - 雞
- Homo sapiens - 人
- Mus musculus - 小鼠，模式生物
- Pan troglodytes - 黑猩猩
- Rattus norvegicus - 大鼠
- Schistosoma haematobium - 埃及血吸虫
- Culex quinquefasciatus - 库蚊
- Solenopsis invicta - 火蚁
- Nasonia vitripennis - 金小蜂
- Linepithema humile - 阿根廷蚁
参考文献编辑
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外部連結编辑
参见编辑
- 基因组
- 全基因组测序
- 人类基因组计划
- 遗传学
- 已测序真核生物基因组列表
- 已测序古菌基因组列表
- 已测序细菌基因组列表
- 已测序质体基因组列表