PANGOLIN
SARS-CoV-2系的数据库
PANGOLIN(Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages,中文又翻譯為彭高命名系統)是一个由Rambaut Lab成员开发的软件工具,與其相关的网络应用由位於英國南劍橋郡的基因组病原体监测中心开发[2]。該工具可以被用來對严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2的基因譜系進行动态命名(PANGO命名法)[3]。
PANGOLIN logo | |
首次发布 | 2020年4月30日 |
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当前版本 |
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源代码库 | github |
编程语言 | Python |
许可协议 | GNU通用公共许可证 |
网站 | pangolin |
據此命名系統的發起人之一Andrew Rambaut所說,SARS-CoV-2有數以萬計的基因體,該基因體數量可是前所未見的,由於截至2020年7月還沒有共識去為SARS-CoV-2種系命名,因此就訂出這個Pango Lineage系統來為基因體譜系命名。
参考文献编辑
- ^ Release 4.3.1. 2023年7月26日 [2023年8月1日].
- ^ Real-Time Epidemiology for COVID-19. www.pathogensurveillance.net. [22 January 2021]. (原始内容存档于2021-01-17).
- ^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology. 2020, 5 (11): 1403–1407 [2021-05-15]. PMID 32669681. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. (原始内容存档于2020-12-24).
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