CpG岛
CpG島(CpG islands)是指DNA上一個區域,此區域含有大量相聯的胞嘧啶(C)、鳥嘌呤(G),以及使兩者相連的磷酸酯鍵(p)。哺乳類基因中的啟動子上,含有約40%的CpG島(人類約70%)。一般CpG島的長度約300到3000個鹼基對(bp)。
常用的正式定義是指一個至少含有200bp的區域,其中GC所佔比例超過50%,且CpG的觀察值/預測值比例必須高於0.6。此部份的CpG島與基因相連,可用來作為限制酶的辨識位置。
几乎管家基因都含有CpG岛;一般位于基因的5’端区域;大多数CpG岛是甲基化的(70%~80%);CpG岛中的核小体中H1含量低,其他组蛋白被广泛乙酰化,并具有超敏感位点;未甲基化CpG岛可能说明基因具有潜在活性。
參見编辑
- CpG位点(CpG site)
參考文獻编辑
- Fatemi, M; Pao, Martha M.; Jeong, Shinwu; Gal-Yam, Einav Nili; Egger, Gerda; Weisenberger, Daniel J.; Jones, Peter A. Footprinting of mammalian promoters: use of a CpG DNA methyltransferase revealing nucleosome positions at a single molecule level. Nucleic Acids Research. 2005-11-27, 33 (20): e176 [2017-06-05]. ISSN 1362-4962. PMC 1292996 . PMID 16314307. doi:10.1093/nar/gni180. (原始内容存档于2019-06-09).
- Saxonov, S; Berg, P, Brutlag, DL. A genome-wide analysis of CpG dinucleotides in the human genome distinguishes two distinct classes of promoters. PNAS. January 2006, 103 (5) [2007-02-23]. PMID 16432200. (原始内容存档于2006-05-08).
- Feil, R; Berger, F. Convergent evolution of genomic imprinting in plants and mammals. Trends in Genetics. May 2007, 23 (4).
外部連結编辑
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