結構變異
結構變異(Structural variation),又稱為基因體結構變異,是生物染色體上結構的變異,由一個物種基因體中的多種變異所組成,通常包括微觀和亞微觀類型,如缺失、重覆、拷貝數變異、插入、倒位和易位等。過去討論結構變異,多指涉長度介於1Kb與3Mb之間的序列,大於單核苷酸多態性並且小於染色體畸變(雖然就定義上有一些重叠)[1],但隨著全基因組測序技術的發達,現在結構變異的定義已擴大為大於50b的序列[2]。結構變異不一定會影響表現型,有些結構變異與遺傳疾病有關,但也有許多與其無關。[3][4]近期有關結構變異的研究發現結構變異比單核苷酸多態性更難檢測。正常人群的基因組中,約有13%的區域為結構變異,而且至少有240個基因有同型合子缺失的情形,意味著這些基因可能在人類是非必需的。[4]每個人的基因組中,可能多達數百萬個核苷酸為結構變異,可能對人類多樣性與疾病易感受性有重要影響。
參考文獻编辑
- ^ Feuk, Lars; Carson, Andrew R.; Scherer, Stephen W. Structural variation in the human genome. Nature Reviews Genetics. 2006, 7 (2): 85–97. PMID 16418744. doi:10.1038/nrg1767.
- ^ Alkan, Can; Coe, Bradley P.; Eichler, Evan E. Genome structural variation discovery and genotyping. Nature Reviews Genetics. 2011-03-01, 12 (5): 363–376 [2019-02-16]. ISSN 1471-0056. PMC 4108431 . PMID 21358748. doi:10.1038/nrg2958. (原始内容存档于2020-11-17) (英语).
- ^ Brandler, William M.; Antaki, Danny; Gujral, Madhusudan; Noor, Amina; Rosanio, Gabriel; Chapman, Timothy R.; Barrera, Daniel J.; Lin, Guan Ning; Malhotra, Dheeraj. Frequency and Complexity of De Novo Structural Mutation in Autism. The American Journal of Human Genetics. 24 March 2016, 98 (4): 667–79. PMC 4833290 . PMID 27018473. doi:10.1016/j.ajhg.2016.02.018.
- ^ 4.0 4.1 Sudmant, Peter H.; Rausch, Tobias; Gardner, Eugene J.; Handsaker, Robert E.; Abyzov, Alexej; Huddleston, John; Zhang, Yan; Ye, Kai; Jun, Goo. An integrated map of structural variation in 2,504 human genomes. Nature. 30 September 2015, 526 (7571): 75–81. Bibcode:2015Natur.526...75.. PMC 4617611 . PMID 26432246. doi:10.1038/nature15394.
外部連結编辑
- 1000个基因组项目 (页面存档备份,存于互联网档案馆)
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