| 名称 | 成立或划归时间 | 所在地 | 网址 |
|---|
| 中国科学院数学与系统科学研究院 | 1998年 | 北京 | http://www.amss.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院应用数学研究所 | 1979年 | 北京 | http://www.amt.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院计算数学与科学工程计算研究所 | 1956年 | 北京 | http://www.cc.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院力学研究所 | 1956年 | 北京 | http://www.imech.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院物理研究所 | 1950年 | 北京 | http://www.iop.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院理论物理研究所 | 1978年 | 北京 | http://www.itp.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院高能物理研究所 | 1950年 | 北京 | http://www.ihep.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院理化技术研究所 | 1975年 | 北京 | http://www.ipc.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院化学研究所 | 1956年 | 北京 | http://www.ic.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院大连化学物理研究所 | 1952年 | 大连 | http://www.dicp.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院过程工程研究所 | 1958年 | 北京 | http://www.ipe.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院地理科学与资源研究所 | 1999年 | 北京 | http://www.igsnrr.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院声学研究所 | 1964年 | 北京 | http://www.ioa.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院生态环境研究中心 | 1975年 | 北京 | http://www.rcees.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院国家天文台 | 2001年 | 北京 | http://www.nao.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海天文台 | 1962年 | 上海 | http://www.shao.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院紫金山天文台 | 1934年 | 南京 | http://www.pmo.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院地质与地球物理研究所 | 1999年 | 北京 | http://www.igg.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院地质研究所 | 1951年 | 北京 | |
| 中国科学院地球物理研究所 | 1950年 | 北京 | |
| 中国科学院地质与地球物理研究所兰州油气资源研究中心 | 2004年 | 兰州 | http://www.lig.cas.cn（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院遥感与数字地球研究所 | 2012年 | 北京 | http://www.radi.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院遥感应用研究所 | 1979年 | 北京 | http://www.irsa.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院对地观测与数字地球科学中心 | 2007年 | 北京 | http://www.ceode.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院遥感卫星地面站 | 1986年 | 北京 | http://www.ceode.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院航空遥感中心 | 1985年 | 北京 | https://web.archive.org/web/20150928004809/http://www.cars.radi.cas.cn/ |
| 中国科学院大气物理研究所 | 1966年 | 北京 | http://www.iap.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所 | 1957年 | 北京 | http://www.ivpp.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院计算技术研究所 | 1956年 | 北京 | http://www.ict.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院北京生命科学研究院 | 2009年 | 北京 | http://www.biols.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院动物研究所 | 1950年 | 北京 | http://www.ioz.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院植物研究所 | 1950年 | 北京 | http://www.ib.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院心理研究所 | 1951年 | 北京 | http://www.psych.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院微生物研究所 | 1958年 | 北京 | http://www.im.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院生物物理研究所 | 1957年 | 北京 | http://www.ibp.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 2001年 | 北京 | http://www.genetics.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院遗传研究所 | 1959年 | 北京 | |
| 中国科学院发育生物学研究所 | 1980年 | 北京 | |
| 中国科学院北京基因组研究所 | 2003年 | 北京 | http://www.big.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院软件研究所 | 1985年 | 北京 | http://www.iscas.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院信息工程研究所 | 2011年 | 北京 | http://www.iie.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院数据与通信保护研究教育中心 | 1985年 | 北京 | https://web.archive.org/web/20180314233839/http://dacas.cn/ |
| 中国科学院半导体研究所 | 1960年 | 北京 | http://www.semi.ac.cn（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院微电子研究所 | 1965年 | 北京 | http://www.ime.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院电子学研究所 | 1956年 | 北京 | http://www.ie.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院自动化研究所 | 1956年 | 北京 | http://www.ia.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院电工研究所 | 1963年 | 北京 | http://www.iee.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院工程热物理研究所 | 1980年 | 北京 | http://www.etp.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院国家空间科学中心 | 1958年 | 北京 | http://www.nssc.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院自然科学史研究所 | 1957年 | 北京 | https://web.archive.org/web/20110430181349/http://www.ihns.ac.cn/ |
| 中国科学院科技政策与管理科学研究所 | 1985年 | 北京 | https://web.archive.org/web/20100210073556/http://www.casipm.ac.cn/ |
| 中国科学院光电研究院 | 2003年 | 北京 | http://www.aoe.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院空间应用工程与技术中心 | 2012年 | 北京 | http://www.csu.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 | 1999年 | 长春 | http://www.ciomp.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海光学精密机械研究所 | 1964年 | 上海 | http://www.siom.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院光电技术研究所 | 1970年 | 成都 | http://www.ioe.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院青藏高原研究所 | 2003年 | 北京 | http://www.itpcas.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 国家纳米科学中心 | 2003年 | 北京 | http://www.nanoctr.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院天津工业生物技术研究所 | 2007年 | 天津 | http://www.tib.cas.cn（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院山西煤炭化学研究所 | 1954年 | 太原 | http://www.sxicc.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院金属研究所 | 1953年 | 沈阳 | http://www.imr.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院沈阳应用生态研究所 | 1954年 | 沈阳 | http://www.iae.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院沈阳自动化研究所 | 1958年 | 沈阳 | http://www.sia.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院海洋研究所 | 1950年 | 青岛 | http://www.qdio.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 | 2009年 | 青岛 | https://web.archive.org/web/20141216182900/http://www.qibebt.cas.cn/ |
| 中国科学院烟台海岸带研究所 | 2009年 | 烟台 | http://www.yic.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院长春应用化学研究所 | 1948年 | 长春 | http://www.ciac.jl.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院东北地理与农业生态研究所 | 2002年 | 长春 | http://www.neigae.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 | 1928年 | 上海 | http://www.sim.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海技术物理研究所 | 1958年 | 上海 | http://www.sitp.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海硅酸盐研究所 | 1959年 | 上海 | http://www.sic.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海有机化学研究所 | 1928年 | 上海 | http://www.sioc.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海应用物理研究所 | 1959年 | 上海 | http://www.sinap.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海巴斯德研究所 | 2005年 | 上海 | http://www.shanghaipasteur.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院上海药物研究所 | 1932年 | 上海 | http://www.simm.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院福建物质结构研究所（中科院海西研究院） | 1960年 | 福州 | http://www.fjirsm.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院城市环境研究所 | 2006年 | 厦门 | http://www.iue.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院宁波材料技术与工程研究所 | 2007年 | 宁波 | http://www.nimte.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院南京地质古生物研究所 | 1951年 | 南京 | http://www.nigpas.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院南京土壤研究所 | 1953年 | 南京 | http://http （页面存档备份，存于互联网档案馆）://www.issas.ac.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院南京地理与湖泊研究所 | 1959年 | 南京 | http://http （页面存档备份，存于互联网档案馆）://www.niglas.ac.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院肿瘤与基础医学研究所 | 2019年 | 杭州 | https://www.ibmc.ac.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 | 2006年 | 苏州 | http://http （页面存档备份，存于互联网档案馆）://www.sinano.cas.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 | 2012年 | 苏州 | http://http （页面存档备份，存于互联网档案馆）://www.sibet.ac.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院合肥物质科学研究院 | 2003年 | 合肥 | https://www.hf.cas.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院武汉岩土力学研究所 | 1958年 | 武汉 | http://http （页面存档备份，存于互联网档案馆）://www.whrsm.cas.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院武汉病毒研究所 | 1956年 | 武汉 | http://www.whiov.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院水生生物研究所 | 1950年 | 武汉 | http://www.ihb.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院武汉植物园 | 1958年 | 武汉 | http://www.whiob.ac.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院南海海洋研究所 | | | |
| 中国科学院华南植物园 | | | |
| 中国科学院广州能源研究所 | | 广州 | |
| 中国科学院广州地球化学研究所 | | 广州 | |
| 中国科学院广州生物医药与健康研究所 | | 广州 | http://www.gibh.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院亚热带农业生态研究所 | | | |
| 中国科学院深圳先进技术研究院 | 2006年 | 深圳 | https://www.siat.ac.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院三亚深海科学与工程研究所 | 2011年 | 三亚 | https://web.archive.org/web/20171121104143/http://www.sidsse.cas.cn/ |
| 中国科学院重庆绿色智能技术研究院 | 2012年 | 重庆 | http://www.cigit.cas.cn（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院成都生物研究所 | | 成都 | |
| 中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所 | | 成都 | |
| 中国科学院昆明动物研究所 | | 昆明 | |
| 中国科学院昆明植物研究所 | | 昆明 | |
| 中国科学院西双版纳热带植物园 | | | |
| 中国科学院地球化学研究所 | | | |
| 中国科学院西安光学精密机械研究所 | | 西安 | |
| 中国科学院国家授时中心 | | 西安 | |
| 中国科学院地球环境研究所 | | | |
| 中国科学院近代物理研究所 | 1957年 | 兰州 | https://imp.cas.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院兰州化学物理研究所 | 1958年 | 兰州 | http://www.licp.cas.cn/ （页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院西北生态环境资源研究院 | | 兰州 | http://www.nieer.cas.cn/（页面存档备份，存于互联网档案馆） |
| 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所 | | | |
| 中国科学院青海盐湖研究所 | | | |
| 中国科学院西北高原生物研究所 | | | |
| 中国科学院新疆理化技术研究所 | | 乌鲁木齐 | |
| 中国科学院新疆生态与地理研究所 | | 乌鲁木齐 | |
