人类Y染色体DNA单倍型类群
遺傳單倍型的類型
人类Y染色体DNA单倍型类群（Human Y-chromosome DNA haplogroup）是利用Y染色体遺傳變異特性進行人類學研究的一門科學，主要用于研究人類的“非洲起源論”及以後的種群分布的遺傳學證據。
理论基础编辑
| Y染色體 | |
|---|---|
 | |
| 物種 | Homo sapiens |
| 基因數量 | 78 |
人類有23對46条染色体，其中22對44条为常染色体，另外一對為性染色体，XY组合的为男性，XX组合的为女性。Y染色体只能父子相传，所以研究Y染色体，可以发现人群在父系關係上的迁徙和发展。
人类Y染色体谱系树是根据Y染色体单倍型类群的不同把全部现代智人分为不同类型，用从A到T的字母作为索引，使用数字和小写字母来进一步细分。谱系树中的父节点代表的对应基因突变是所有子节点共有的，但反之不然。
Y染色体亚当，在遗传学上是理论上人类父系的最近共同祖先，生活在10-20万年前。
智人及近亲支序图编辑
| 约70万年前男性 |
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支序图编辑
| 单倍群类型A00-T |
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单倍型类群编辑
单倍型类群A 和 B编辑
单倍型类群A是非洲人的子单倍型类群，现代的所有单倍型类群起源点。BT是单倍型类群A的分支。 它有两个主要谱系，单倍型类群B和CT。
- 单倍型类群 A (M91) 分布于非洲,，特别分布于科伊桑人、埃塞俄比亚人（特别分布于贝塔以色列）和尼罗-撒哈拉人
- BT (M42, M94, M139, M299)约55000年前分离
- 单倍型类群 B (M60) 分布于非洲, 特别分布于俾格米人和Hadzabe
- CT (见下)
- BT (M42, M94, M139, M299)约55000年前分离
有M168 (CT)变异的单倍型类群编辑
定义突变分离CT（除A和B的所有单倍型类群）为M168和M294。这些突变早于“走出非洲”的迁移。DE突变的定义可能发生在非洲东北部，大约65000年前。[2] P143突变定义了单倍型类群CF。可能发生在那时，将现代人类带至亚洲南部海岸。
- 单倍型类群 CF（P143）：分布于非洲之外、包括整个欧亚大陆、大洋洲、和美洲
- 单倍型类群 DE（M1、 M145、 M203）：约65000年前
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单倍型类群 F (G, H & IJK)编辑
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单倍型类群F发现于大约90％的世界人口，但几乎完全在撒哈拉以南非洲地区之外。IJ的突变对应于45000年前的一个中东或南亚地区的移民浪潮，随后迁移到欧洲 (克罗马儂人)。单倍型类群G，30000年前起源于中东地区，或更东的地区至巴基斯坦，并迁移至欧洲引发新石器革命。单倍型类群H可能30000-40000年前起源于印度，并随罗姆人迁移至西方。单倍型类群K在欧亚大陆, 澳洲和南太平洋分布极广。
- 单倍型类群 F*分布于南部印度、斯里兰卡、云南、朝鲜半岛
单倍型类群 G分布 - 单倍型类群 G1
- 单倍型类群 G2
- 单倍型类群 G2a
- 单倍型类群 G2a1
- 单倍型类群 G2a2
- 单倍型类群 G2a3
- 单倍型类群 G2a3a
- 单倍型类群 G2a3b
- 单倍型类群 G2a3b1
- 单倍型类群 G2b
- 单倍型类群 G2c (之前为单倍型类群 G5)
- 单倍型类群 G2c1
- 单倍型类群 G2a
单倍型类群 H分布 - 单倍型类群 H1
- 单倍型类群 H2
- 单倍型类群 IJK
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单倍型类群 K (M9)编辑
单倍型类群L主要分布于南亚。单倍型类群M则最流行于美拉尼西亚。NO单倍型类群在35000-40000年前出现在亚洲。单倍型类群N可能起源于东南亚并扩散到西伯利亚北部和西部，最常见分布于乌拉尔语系人群。单倍型类群O最常见分布于东亚和东南亚，少量分布于大洋洲、中亚和南亚。单倍型类群P引出了群组Q和R，并且很少发现在其未分化的阶段。很可能起源于中亚或阿尔泰地区。单倍型类群Q也起源于中亚，向东迁移到北美。
- 单倍型类群 K*分布于美拉尼西亚和澳洲
- 单倍型类群K1（之前为单倍型类群 K3）分布于印度次大陆
- 单倍型类群K2（之前为单倍型类群 K4）
- 单倍型类群K3（之前为单倍型类群 K6）分布于美拉尼西亚和玻利尼西亚
- 单倍型类群K4 分布于巴厘岛
- 单倍型类群 LT (K1/L298/P326)
- 单倍型类群 MNOPS (K2/K(xLT)/rs2033003/M526)
- 单倍型类群K2a (M2313)
- 单倍型类群K2b (P331)
单倍型类群 NO (M214)编辑
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NO单倍型类群在35000-40000年前出现在东亚。单倍型类群N可能起源于亚洲东部并向北和向西传播于西伯利亚，高频分布于一些乌拉尔语系人群。单倍型类群O最常分布于东亚、东南亚等。
- 单倍型类群 NO (M214)35000-40000年前分离(极少发现)。
单倍型类群 P编辑
P是单倍群K的一个分支，单倍群NO是另一个分支。P-P295有两个分支：P1 (P-M45)和 P2 (P-B253)。P1是单倍群Q和单倍群R的祖先。Q-M242和R-M207，都有一个共同的标记M45。虽然今天东西伯利亚和中亚都有更多P*，但是P*(P295)可能起源于东南亚，向北边迁移，分为单倍群R和单倍群Q，向欧洲和美洲迁徙。目前，单倍群Q和R包括很多欧洲人、美洲原住民、和南亚人。
单倍型类群 Q编辑
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Q被定义由SNP M242。认为出现在大约35000-40000年前的中亚。单倍型类群Q的亚类型和定义变异，根据2008 ISOGG树[6]在下文提供。作为一种新型的Q系（Q5），在印度人中已经被低频率发现[7]
2008 ISOGG树
单倍型类群 R编辑
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单倍型类群R的定义由SNP M207。大部分单倍型类群 R表现为R1a和R1b。R1a可能起源于欧亚大草原，伴随斯基泰人文化和原始印欧语人群的扩张。主要分布于中亚、南亚和东欧。R1b可能起源于中亚。在西欧占主导地位，也稀少分布在亚洲和非洲。其子群R1b1a2 (M269)在现代欧洲人分布最常见，特别在西欧。
单倍型类群在欧洲的时间发展编辑
| 单倍型类群 | 可能年代 | 可能原居地 | 高分布人群 |
| K | 40,000 年前 | 南亚或西亚 | |
| T | 30,000 年前 | 西亚 | |
| J | 30,000 年前 | 西亚 | 阿拉伯人（亚洲部分） |
| R | 28,000 年前 | 中亚 | |
| E1b1b-M35 | 26,000 年前 | 东非 | |
| I | 25,000 年前 | 巴爾幹 | |
| R1a1 | 21,000 年前 | 南俄羅斯 | |
| R1b | 20,000 年前 | 里海周边或中亚 | |
| E1b1b-M78 | 18,000 年前 | 埃及及利比亞 | |
| G | 17,000 年前 | 高加索 | |
| I2 | 17,000 年前 | 巴爾幹 | |
| J2 | 15,000 年前 | 北部美索不达米亚 | |
| I2b | 13,000 年前 | 中欧 | |
| N1c1 | 12,000 年前 | 西伯利亞 | |
| I2a | 11,000 年前 | 巴爾幹 | |
| R1b1b2 | 10,000 年前 | 高加索西部或北部 | |
| J1 | 10,000 年前 | 阿拉伯半島 | |
| E1b1b-V13 | 10,000 年前 | 巴爾幹 | 阿爾巴利亞 |
| I2b1 | 9,000 年前 | 德國 | |
| I2a1 | 8,000 年前 | 薩丁尼亞 | |
| I2a2 | 7,500 年前 | 狄那里克阿尔卑斯山脉 | |
| E1b1b-M81 | 5,500 年前 | 马格里布 | 柏柏尔人 |
| I1 | 5,000 年前 | 斯堪的纳维亚 | |
| R1b-L21 | 4,000 年前 | 中部或东欧 | |
| R1b-S28 | 3,500 年前 | 阿爾卑斯山一帶 | |
| R1b-S21 | 3,000 年前 | 弗里西亚或中欧 | |
| I2b1a | < 3,000 年前 | 不列顛 |
相关条目编辑
- 东亚和东南亚人群的Y染色体DNA单倍型类群
- Y-chromosome haplogroups by populations
- Y-DNA haplogroups by groups in Europe
- List of Y-DNA single-nucleotide polymorphisms
- List of Y-STR markers
- 人类线粒体DNA单倍体群
- Human mitochondrial DNA haplogroups
- 单倍型类群
- Molecular phylogeny
- 基因学
- Genealogical DNA test
- Conversion table for Y chromosome haplogroups
参考文献编辑
- ^ Petr M, Hajdinjak M, Fu Q, Essel E, Rougier H, Crevecoeur I; et al. The evolutionary history of Neanderthal and Denisovan Y chromosomes.. Science. 2020, 369 (6511): 1653–1656. PMID 32973032. doi:10.1126/science.abb6460.
- ^ Karafet TM、 Mendez FL、 Meilerman MB、 Underhill PA、 Zegura SL、 Hammer MF. New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree. Genome Research. 2008, 18 (5): 830–8 [2012-10-19]. PMC 2336805
. PMID 18385274. doi:10.1101/gr.7172008. （原始内容存档于2008-06-07）. - ^ Passarino, Giuseppe; Cavalleri, Gianpiero L; Lin, Alice A; Cavalli-Sforza, LL; Børresen-Dale, AL; Underhill, PA. Different genetic components in the Norwegian population revealed by the analysis of mtDNA and Y chromosome polymorphisms. European Journal of Human Genetics. 2002, 10 (9): 521–529. PMID 12173029. doi:10.1038/sj.ejhg.5200834.
- ^ Karlsson, Andreas O; Wallerström, Thomas; Götherström, Anders; Holmlund, Gunilla. Y-chromosome diversity in Sweden – A long-time perspective. European Journal of Human Genetics. 2006, 14 (8): 963–970. PMID 16724001. doi:10.1038/sj.ejhg.5201651.
- ^ Xue, Yali; Zerjal, Tatiana; Bao, Weidong; Zhu, Suling; Shu, Qunfang; Xu, Jiujin; Du, Ruofu; Fu, Songbin; Li, Pu; Hurles, Matthew E; Yang, Huanming; Tyler-Smith, Chris. Male Demography in East Asia: A North–South Contrast in Human Population Expansion Times. Genetics. 1 April 2006, 172 (4): 2431–2439. PMC 1456369 . PMID 16489223. doi:10.1534/genetics.105.054270.
- ^ Y-DNA Haplogroup Tree 2010. International Society of Genetic Genealogy. [July 2010]. （原始内容存档于2019-03-30）.
- ^ Sharma, Swarkar; Rai, Ekta; Bhat, Audesh K; Bhanwer, Amarjit S; Bamezaicorresponding, Rameshwar NK. A novel subgroup Q5 of human Y-chromosomal 单倍型类群 Q in 印度. BMC Evol Biol. 2007, 7: 232. PMC 2258157 . PMID 18021436. doi:10.1186/1471-2148-7-232.
- ^ Supplementary Table 2: NRY 单倍型类群 distribution in Han populations （页面存档备份，存于互联网档案馆）, fromonline supplementary material for [1] （页面存档备份，存于互联网档案馆） by Bo Wen et al。, "Genetic evidence supports demic diffusion of Han culture," Nature 431, 302-305 (16 September 2004)
- ^ Table 1: Y-chromosome haplotype frequencies in 49 欧亚大陆n populations, listed according to geographic region （页面存档备份，存于互联网档案馆）, from [2] （页面存档备份，存于互联网档案馆） by R。 Spencer Wells et al。, "The 欧亚大陆n Heartland: A continental perspective on Y-chromosome diversity," Proceedings ofNational Academy of Sciences ofUnited States of America (August 28, 2001)
- ^ "Y-Chromosome Evidence for Differing Ancient Demographic Histories in美洲," （页面存档备份，存于互联网档案馆） Maria-Catira Bortolini et al。, American Journal of Human Genetics 73:524-539, 2003
- ^ Y Chromosome Consortium[永久失效連結]
- ^ 2005 Y-chromosome Phylogenetic Tree, from FamilyTreeDNA。com
- ^ A Nomenclature system forTree of Human Y-Chromosomal Haplogroups（页面存档备份，存于互联网档案馆）, Genome。org
外部連結编辑
- UIUC maps showing worldwide distribution of Y chromosome和Mitochondrial DNA haplogroups
- 《現代人類學通訊》雜誌[永久失效連結]
- youku科普視頻《人類學、族群、姓氏和Y染色體》
- ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree（页面存档备份，存于互联网档案馆）
- Chart ofspeed of different Y chromosomal STR mutation rates[永久失效連結]
- Map of Y Haplogroups*Atlas ofHuman Journey, fromGenographic Project, National Geographic
- DNA Heritage's Y-haplogroup map
- （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- DNA Consulting's Conversion Chart for Male Haplogroups[永久失效連結] (PDF)
- Semino et al。 (2000) Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans: A Y Chromosome Perspective[永久失效連結] Paper that defined "Eu" haplogroups
- Worldfamilies Y Haplogroup & Sub-clade Projects*Kerchner's YDNA Haplogroup Descriptions, Projects & Links
- （页面存档备份，存于互联网档案馆）
| Y染色体最近共同祖先 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1b | A1a-T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1a | A2-T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A2 | A3 | BT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| B | CT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DE | CF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| G | H | IJK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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